Fő kutatási témák

1. Fő kutatási témánk a rosszindulatú tumoros betegek túlélését befolyásoló génexpresszió és mutáció alapú egy- vagy multigénes markerek azonosítása. Ezen kiértékelésekhez az interneten keresztül elérhető rendszereket fejlesztünk, amelyek automatizált módon futtatják le a kívánt elemzéseket. Nemzetközi kollaborációkban veszünk részt a bioinformatikailag azonosított prognosztikus mintázatok validálására.

2. Onkológiai kezelésben alkalmazott célzott terápiás szerekkel szembeni rezisztencia biomarkereinek azonosítása. A kutatás során elsősorban sejtkultúrás modelleket alkalmazva egyes célzott géneket kikapcsolunk, és ezután azt vizsgáljuk, hogy a kemo- és célzott terápiás gyógyszerekkel szembeni érzékenységet tudtuk-e változtatni.

3. Genotípus összekapcsolása klinikai kimenettel. A projekt keretében a TCGA konzorcium által generált következőgenerációs szekvenálási adatokat dolgozunk fel. Ennek eredményeképpen több ezer beteg tumorának meg fogjuk határozni a mutációs állapotát és a génexpresszió szintjét valamennyi gén esetében. A kétféle adat összekapcsolásával azt tudjuk vizsgálni, hogy egy-egy genotípusbeli eltérés milyen klinikai következményekkel jár.

4. Az emlőkarcinóma a leggyakrabban diagnosztizált daganatos megbetegedés, és a második leggyakoribb daganathoz köthető halálok nőkben. Az emlőkarcinómák 75%-a ösztrogén receptor-pozitív (ER+), ahol az ösztrogén receptor (ESR1) gátlása kulcsszerepet tölt be a betegség kimenetében. Bár az ESR1 funkcionális szerepe tisztázott és közvetlen gátlása széles körben alkalmazott, a gátlásra adott válasz mértéke korlátozott és a betegek felében alakul ki rezisztencia. Az ESR1 komplex kölcsönhatásba lép az aktivitását serkentő/gátló koregulátorokkal, melyek meghatározzák a jelátvitel kimenetét. Hatékonyabb terápiás szerek fejlesztéséhez nélkülözhetetlen az ESR1-aktivitását befolyásoló génhálózat jobb megismerése. Az onkogén tulajdonságokkal rendelkező RNS-kötő fehérjék több humán daganatos megbetegedésben jutnak egyre kiemelkedőbb szerephez, mint potenciális terápiát befolyásoló tényezők. Előzetes genomikai analíziseink alapján kiemelt a CIRBP (Cold inducible-RBP) potenciális funkciója ER+ emlőkarcinómában. A CIRBP szoros összefüggést mutat az ER jelátvitel intenzitásával, a betegek túlélésével, valamint a tamoxifenre adott válasz mértékével. Célunk a CIRBP funkciójának vizsgálata mint potenciális prognosztikus biomarker és terápiás célpont ER+ emlőkarcinómában.

Az NKFIH támogatásával megvalósuló projekt (2018-2.1.17-TÉT-KR-2018-00001).

Saját fejlesztések:

KM-plotter: https://kmplot.com/analysis/

ROC Plotter: http://www.rocplot.org/

muTarget: https://www.mutarget.com/

Recurrence Online: http://www.recurrenceonline.com/

Genotype 2 Outcome: http://www.g-2-o.com/

Scientometrics: https://www.scientometrics.org/

COVIDoutcome: https://www.covidoutcome.com/

TNMplot: https://tnmplot.com/analysis/

Multiple Testing Correction: https://multipletesting.com/

Aktuális együttműködések

• Igor Roninson, University of South Carolina, USA
• Saraswati Sukumar, John Hopkins, Baltimore, USA
• Pusztai Lajos, Yale Cancer Center, New Haven, USA
• Sophia Chernikova, Stanford University, USA
• Yatrik Shah, University of Michigan, USA
• Mathieu Lupien, University of Toronto, Kanada
• Libero Santarpia, Humanitas Clinical and Research Center, Olaszország
• Reinhold Schäfer, Charité Berlin, Németország
• Jan Budczies, Charité Berlin, Németország
• Thomas Karn, University of Frankfurt, Németország
• Irina Nazarenko, University of Freiburg, Németország
• Antonio Postigo, ICREA, Spanyolország
• Luca Magnani, Imperial College, London, UK
• Michael Lisanti, University of Manchester, UK
• Simak Ali, Imperial College, London, UK
• Michel Aguet, EPFL, Lausanne, Svájc
• Casanova Emilio, Medical University of Vienna, Ausztria
• Baharia Mograbi, University of Nice-Sophia Antipolis, Franciaország
• Pascale Cohen, University of Lyon, Franciaország
• Khalid Khabar, King Faisal Research Centre, Riyadh, Szaúd-Arábia
• Takayuki Iwamoto, Okayama University, Japán
• Yong Han, Peking University, Kína

Oktatási tevékenység

• PhD témavezetés: Semmelweis Egyetem Patológiai Tudományok Doktori Iskola
• Graduális oktatás: Patológia @ Semmelweis Egyetem
• Graduális oktatás: Gyermekgyógyászat @ Semmelweis Egyetem
• Graduális oktatás: Bioinformatika @ Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kar
• Posztgraduális oktatás: Tumorprogresszió és előrejelzése @ Semmelweis Egyetem Doktori Iskola
• Posztgraduális oktatás: Bioinformatika @ Semmelweis Egyetem Doktori Iskola

Saját honlap

http://gyorffy.semmelweis.hu

Publikációk

https://scholar.google.com/citations?hl=hu&user=KUKTJFYAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate

Vezető

Név	Telefonszám	Csoport	Iroda
Dr. Győrffy Balázs	+361-382-6722	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	D3.11A

Munkatársak

Név	Telefonszám	Csoport	Iroda
Dr. Menyhárt Otilia	+361-382-6745	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	É3.10A
Dr. Munkácsy Gyöngyi	+361/382-6745	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	É3.10A
Dr. Bartha Áron	+361/382-6745	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	É3.10A
Müller Dalma	+361/382-6745	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	É3.10A
Kovács Szonja Anna	+361/382-6745	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	É3.10A
Fekete János Tibor	+361/382-6745	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	É3.10A
Lakatos Viktória	+361/382-6745	Onkológiai Biomarker Kutatócsoport	É3.10A